Polegar Tom conta a história de um rapaz nascido numa família pobre de lenhadores que não é literalmente maior do que uma polegada. Dois estranhos, espantados com o pequeno tamanho do rapaz, tentam comprá-lo ao pai. Tom tenta enganar os dois homens e voltar para o seu pai. Para regressar a casa, Tom tem de fazer amizade com ladrões locais, fugir do estômago de uma vaca e guiar um lobo até casa.