Polegar Tom conta a história de um rapazinho nascido numa família pobre de lenhadores que, literalmente, não é maior do que um polegar. Dois estranhos, espantados com a pequena estatura do rapaz, tentam comprar o rapaz ao pai. Tom tenta enganar os dois homens e fugir para junto do pai. Na sua viagem de regresso a casa, Tom tem de fazer amizade com alguns ladrões locais, escapar do estômago de uma vaca e guiar um lobo até à sua casa.