Polegar Tom conta a história de um rapaz nascido numa família pobre de lenhadores que não é, literalmente, maior do que um polegar. Dois estranhos, espantados com a pequena estatura do rapaz, tentam comprá-lo ao pai. Tom tenta enganar os dois homens e fugir para junto do pai. Na sua viagem de regresso a casa, Tom tem de fazer amizade com alguns ladrões locais, fugir do estômago de uma vaca e guiar um lobo até à sua casa.